Cabo Frio é uma das cidades citadas em um pedido de apuração do subprocurador-geral do Ministério Público junto ao TCU, Lucas Rocha Furtado, que investiga possível favorecimento do governo Lula (PT) a prefeituras aliadas. Além de Cabo Frio, outras cidades mencionadas incluem Belford Roxo, Mauá, Araraquara, Diadema e Hortolândia. Essas cidades receberam verbas federais superiores às solicitadas, sem justificativas detalhadas ou aval técnico, com algumas transferências sendo priorizadas por pedido escrito à mão. Em Cabo Frio, o Ministério da Saúde destinou R$ 55,4 milhões para atendimento de média e alta complexidade (MAC), valor que superou o teto permitido. A transferência gerou suspeitas após a nomeação de Márcio Sampaio, filho da ministra, como secretário de Cultura da cidade, apesar de sua falta de experiência na área.
O Palácio do Planalto afirmou que os recursos são liberados de forma documentada, seguindo critérios objetivos, mas não respondeu sobre o suposto favorecimento às cidades mencionadas. A prefeitura de Cabo Frio defendeu a liberação das verbas, alegando que segue critérios objetivos e que a gestão atual está trabalhando para garantir esses recursos em benefício do município.